Nedefra og op ser Frivillighuset Vindrosens organisation ud som følger:
Medarbejderne står for den daglige drift
Der er fire fastansatte i Vindrosen, som servicerer foreningerne, vejleder borgere i sekretariatet og står for den daglige drift af husene i Esbjerg, Ribe og Bramming.
Bestyrelsen udstikker opgaverne for medarbejderne
Medarbejdernes opgaver bestemmes af bestyrelsen, som dermed er ansvarlig for den daglige drift.
Repræsentantskabet vælger bestyrelsen
Repræsentantskabet består af Vindrosens medlemsforeninger. Ved det årlige repræsentantskabsmøde vælger medlemmerne bestyrelsesmedlemmer.
Repræsentantskabet er Frivillighuset Vindrosens øverste myndighed.